ダーウィンの唱えた進化論と、現在主流の最先端の進化論ではどのような点に違いがありますか?

http://q.hatena.ne.jp/1215530800
1.の方の「基本的に全てDNAと進化論に基づき説明されます」という説明が興味深かったです。言われてみれば、他にベースになるようなものって、あまり思いつかないですもんね。